Gomes, aki utónevét az egykori kiváló portugál támadóról, Fernando Gomesről kapta, a Boavista FC-ben lett profi labdarúgó, s első nagy sikerét a Benfica ellen érte el, amikor a Portugál Kupa döntőjében éppen őket győzték le. Az U-válogatottak alaptagjaként megfordult az 1996-os olimpián is, s mivel 21 esztendősen 15 gólt ért el a bajnokságban, a válogatottban is debütálhatott, majd a Benfica igazolta le őt. A Sasok között kétszer lett portugál bronzcipős, mindkétszer a brazil Jardel mögött, s 101 bajnokin 60 gólt termelt első három idényében.
A futballrajongók a kocanézőkkel egyetemben mégis csak a 2000-es Európa-bajnokságon előadott produkcióit említhetik, mint első Gomes-emlékeket. Az akkor is a Benficában játszó csatár rögvest az első meccsen az angoloknak beköszönt: a 0-2-ről megfordított meccs hőse lett végül, mivel övé volt a harmadik portugál találat. Aztán remek formában futballozta végig az egész kontinenstornát, az elődöntőben ő szerezte az első gólt.
Ennek a mérkőzésnek a zárása azonban már nem sikerült valami fényesre, a franciáknak megítélt hírhedett tizenegyes után hárman toporzékoltak túl hevesen, s Abel Xavier és Paolo Bento mellett az egyik hisztiző éppen Nuno Gomes volt. Jutalomképpen hét hónapos, válogatott fellépésekre vonatkozó eltiltást kapott az UEFA-tól. A futballteljesítménye azonban nagyon tetszett az akkor még virágzó Fiorentina vezéreinek: 17 millió euróval bírták rá a Benficát a transzferre.
A lilákkal kezdésként begyűjtött egy Olasz Kupát, a következő évben viszont a klub csődbe ment, ő meg vissza Lisszabonba. "Útközben" mindössze egy szűk félórát játszott az ázsiai világbajnokságon, hiszen ekkor már Pedro Pauleta volt az első számú luzitán középcsatár. Pedog Nuno Gomes előtte öt selejtezőn hétszer volt eredményes, mesternégyesével Eusebio válogatottbéli gólcsúcsát is megdöntve.
A Benficában aztán összeszedte magát, s a hazai kontinenstornán újra nemzeti hős lett, köszönhetően a nagy rivális spanyoloknak rúgott góljának (a kispadról szállt be). Nem is maradt el a jutalom: a szövetségi kapitány, Luiz Felipe Scolari közölte, a továbbiakban is Nuno Gomes marad a center, ám a támadó a továbbiakban már nem volt eredményes. Klubjában folyamatosan kellemetlen, visszatérő sérülésekkel bajlódott, egy időre a válogatott keretből is kimaradt.
2006-ban például egyetlen vb-selejtezőn sem kapott szerepet, igaz, a tornára nem merte nem magával vinni Scolari. A bajnokságban újra parádézó Nuno Gomes újfent csak epizodista volt Pauleta mögött, viszont a bronzmérkőzésen egy szép gólt szerzett. Hazatérve azzal kellett szembesülnie, hogy Francisco Fonseca, Fabrizio Miccoli és Pedro Mantorras miatt néha a kispadra kerül, de nem sértődött meg, sőt példamutató játékának köszönhetően ma már a Benfica legendái között emlegetik.
Ennek megfelelően Pauleta visszavonulása után a válogatottban alapemberré vált, s tíz Eb-selejtezőn három gólt érve el készülhet élete alighanem utolsó nemzetközi tornájára.
1994/95 | Boavista | 17 | 1 | | | |
1995/96 | Boavista | 28 | 7 | | | |
1996/97 | Boavista | 34 | 15 | | | |
1997/98 | Benfica | 33 | 18 | | | |
1998/99 | Benfica | 34 | 24 | | | |
1999/00 | Benfica | 34 | 18 | | | |
2000/01 | Fiorentina | 30 | 9 | | | |
2001/02 | Fiorentina | 23 | 5 | UEFA | 6 | 3 |
2002/03 | Benfica | 27 | 9 | | | |
2003/04 | Benfica | 21 | 7 | UEFA | 5 | 5 |
2004/05 | Benfica | 23 | 7 | UEFA | 6 | 3 |
2005/06 | Benfica | 29 | 15 | BL | 8 | 0 |
2006/07 | Benfica | 24 | 6 | BL+UEFA | 6+6 | 1+1 |
2007/08 | Benfica | 16 | 6 | BL | 7 | 1 |
A táblázatban szereplő adatok sorrendben: év, csapat, mérkőzések száma, szerzett gólok száma, nemzetközi kuparészvétel, nemzetközi kupamérkőzések száma, nemzetközi és válogatott kupatalálkozón szerzett gólok száma és az elért bajnoki átlag. |
Nagy tornák a válogatott színeiben: | 1996 | olimpia | 4 | 1 | 2000 | Európa-bajnokság | 5 | 4 | 2002 | világbajnokság | 2 | 0 | 2004 | Európa-bajnokság | 6 | 1 | 2006 | világbajnokság | 2 | 1 | |