Jonathan Tah még áprilisban jelentette be, hogy az idény végén távozik a Bayer Leverkusentől. A 35-szörös német válogatott labdarúgó 2015 nyarán igazolt Hamburgból a Leverkusenhez, melynek színeiben 402 mérkőzésen 18 gólt szerzett, kiosztott 13 gólpasszt, s az előző idényben bajnoki címet és Német Kupa-győzelmet ünnepelhetett, majd a német Szuperkupát is megnyerte a Bayerrel.
A német védő kapcsán leginkább a Barcelona érdeklődéséről lehetett hallani, de több angol csapat és a Bayern München is kiszemelte, végül a bajorok lettek a befutók.
A német bajnok együttes a klub hivatalos oldalán jelentette be, hogy ingyen igazolható játékosként szerződtette Jonathan Taht. A 29 éves védő a négyes mezszámot kapta, szerződése 2029. június 30-ig szól.
„Nemzetközi és élvonalbeli tapasztalattal rendelkező játékosként következetességet és minőséget hoz a csapatunkba. Igazi értéket jelent, ráadásul azt is bebizonyította, hogy képes címeket nyerni” – árulta el az átigazolást követően Jan-Christian Dreesen, a Bayern München vezérigazgatója. Max Eberl sportigazgató így értékelt: „Nem titok, hogy Tah régóta a radarunkon van. Sok ajánlata volt, de mellettünk döntött, és emiatt nagyon boldogok vagyunk.”
Jonathan Tah ezt mondta az átigazolást követően: „Nagyon boldog vagyok, hogy a Bayern Münchennél lehetek. Szeretnék itt felelősséget vállalni, és minden nap keményen dolgozni, hogy csapatként sikeresek legyünk, és sok címet nyerjünk együtt.”
Tah 2016 márciusában debütált a német válogatottban. Részt vett a 2016-os és a 2024-es Európa-bajnokságon is, eddig 35-ször szerepelt a nemzeti együttes színeiben.