Metzelder – akinek szerződése a nyáron lejár a Schalkénél, és nem hosszabbítja meg azt, hanem visszavonul – a Preussen Münsterben kezdte profi pályafutását, majd hét évet töltött a Borussia Dortmundnál (2000 és 2007 között). A következő állomás karrierjében a Real Madrid volt (2007–2010), ahonnan nevelőegyesületébe, a Schalkéba igazolt 2010 áprilisában.
A rutinos védő a német válogatottban 53-szor lépett pályára, gólt nem szerzett, a 2002-es vb-n ezüstérmes, négy évvel később bronzérmes lett a nationalelffel. A Borussia Dortmunddal német bajnok lett, a Real Madriddal spanyol bajnok és spanyol Szuperkupa-győztes, míg a Schalkéval német Szuperkupa-győztes lett.
Metzelder utolsó tétmeccsét szombaton játssza, amikor a Schalke a Freiburghoz látogat a Bundesliga záró fordulójában.