A hosszú ideig sérülésekkel bajlódó Afellay átment az orvosi vizsgálaton, és csatlakozott a gelsenkircheniek keretéhez. A Schalke vezetőedzője, Huub Stevens a 2008–2009-es idényben a PSV-nél dolgozott együtt Afellayjal.
„Örülök Ibrahim megszerzésének, hiszen kiváló játékos, aki több poszton is használható. Eindhovenben középen szerepelt, de mindkét szélen be tudjuk vetni” – kommentálta az igazolást Stevens.