A 41 esztendős szakember 2012 novemberéig a Valenciát irányította – ahol játékosként is eltöltött több mint öt évet, és pályára lépett két elveszített BL-döntőben is –, míg ezt megelőzően a Liverpoolnál és az Internél másodedzőként segítette Rafa Benítez munkáját.
Pellegrino másfél éves szerződést kötött az argentin bajnokság második szakaszában, a Torneo Finalban hét forduló után sereghajtó Estudiantesszel.