A 43 éves kapus azután jelentette be a visszavonulását, hogy a kolumbiai nemzeti csapat kiesett a brazíliai vb-n.
Az 56-szoros válogatott Mondragón – aki a Japán elleni csoportmeccsen átadta a múltnak Roger Milla 1994-es rekordját – pályafutása legsikeresebb időszakát a Galatasaraynál élte meg, melynek játékosaként 2001 és 2007 között kétszer nyert bajnokságot, s egyszer Török Kupát.
Az Európában a Zaragoza, a Metz és a Köln együttesében is megforduló kapus a kolumbiai Deportivo Caliban kezdte a profi karrierjét, és ott is fejezte be. Összesen tizenegy csapatban védett.